1、模式。USB-HDD：硬盘仿真模式，DOS启动后显示C:盘，HPU盘格式化工具制作的U盘即采用此启动模式。USB-ZIP：大容量软盘仿真模式，DOS启动后显示A盘，FlashBoot制作的USB-ZIP启动U盘即采用此模式。USB-HDD+：增强的USB-HDD模式，DOS启动后显示C:盘。USB-ZIP+：增强的USB-ZIP模式，支持USB-HDD/USB-ZIP双模式启动(根据电脑的不同，有些BIOS在DOS启动后可能显示C:盘，有些BIOS在DOS启动后可能显示A:盘)。USB-CDROM：光盘仿真模式，DOS启动后可以不占盘符。

2、兼容性。USB-HDD：此模式兼容性很高，但对于一些只支持USB-ZIP模式的电脑则无法启动。USB-ZIP：一些老电脑只能支持此模式，但对一些技术较新的电脑兼容性不好，导致不能使用，特别是大容量U盘。USB-HDD+：兼容性高于USB-HDD模式，但对仅支持USB-ZIP的电脑无法启动。在DOS下启动后U盘盘符仍然显示为C:盘。USB-ZIP+：很高的兼容性。USB-CDROM：兼容性一般。

3、优缺点。USB-HDD：格式普及率最高。USB-ZIP：支持的是些老旧的电脑，使用范围太小。USB-HDD+：其缺点在于对仅支持USB-ZIP的电脑无法启动。USB-ZIP+：其缺点在于有些支持USB-HDD的电脑会将此模式的U盘认为是USB-ZIP来启动，从而导致4GB以上大容量U盘的兼容性有所降低。

USB-CDROM：其优点在于可以像光盘一样进行XP/2003安装。制作时一般需要具体U盘型号/批号所对应的量产工具来制作，对于U盘网上有通用的量产工具。USB-CDROM会把U盘分为两个区，一部分不可写入，一部分可以当盘使用，需要量产工具来实现。